相続した物件で管理会社の間違いが発覚！どのように判断すべき？｜専門家に無料相談できる賃貸経営Ｑ＆Ａサイトはお悩み大家さん

相続した物件について質問です。


店舗（ブティック）
平成１２年～２２年間現在の借主へ賃貸。
当初の大家は父でしたが、相続により平成１６年頃～現在まで私が大家です。
２年毎更新でしたが、今回更新をしないとのことで相続後初めて当初の契約内容、敷金のこと等を管理会社に問い合わせたところ、現在更新ごとに発行している内容が原契約と間違っているようだと謝罪がありました。

「現在の契約書内容」
賃料85,000円　敷金170,000円

「当初の契約書」
賃料90,000円　敷金180,000円

「当初の重説、精算書」
賃料90,000円　敷金270,000円

契約時借主へ発行されている精算書は仲介会社から発行されているもので「敷金270,000円」

しかし原契約書は当初から「敷金180,000円」と記載、
さらにその後の更新からは賃料の減額をしたようで「敷金170,000円」に変更されているものの、借主いわく
過去に敷金の変更・返金等はされていないとのことで「敷金は270,000円のはず」と言っています。
覚書なども無いので詳細は不明です。

管理会社も数年前に代替わりをしており当時の状況がわからないとのことで、謝罪と「敷金270,000円に納得がいかない場合、現在の契約書との差額分は支払います」と言ってくれてはいるのですが、、、

間違いが入り組んでいて判断に迷っています。
どうすべきでしょうか

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